شنیده ها حاکیست استعفای وزیر اموزش پرورش به دلیل نارضایتی رییس جمهور از عملکرد وی بوده است و این استعفا با درخواست حسن روحانی صورت گرفته است.
سه تحصن اعتراضی توسط معلمان و چندین بیانیه اعتراضی به وضعیت صنفی و رفاهی دانشجویان دانشگاه شهید رجایی و دانشگاه فرهنگیان در کارنامه مردود بطحایی وجود دارد.
افزایش نیافتن حقوق مصوب مجلس به دانشجو معلمان متعد خدمت دانشگاههای شهید رجایی و فرهنگیان از دیگر مواردی است که باعث مقبولیت نداشتن بطحایی شده است.
سید محمد بطحایی استعفای خود را در آخرین جلسه هیات دولت تقدیم رییس جمهور کرد، اما این استعفا هنوز پذیرفته نشده است. گفته می شود بطحایی به دلیل شرکت در انتخابات مجلس استعفا داده است.
وزیر آموزش و پرورش به تازگی به خاطر انتشار کلیپ رقص در مدارس تحت فشار بوده است. هم چنین گفته می شود بطحایی به دلیل مقابله با مافیای کنکور، از سوی این سوداگران تحت فشار بوده است.
پس از انتشار این خبر، معاونت روابط عمومی و اطلاعرسانی آموزش و پرورش، خبر استعفای وزیر آموزش و پرورش را تکذیب کرد